Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB1P37275 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB1P37275 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms