Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPC1P35052 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms