Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms