Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms