Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD34P28906 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD34P28906 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD34P28906 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms