Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
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