Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms