Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA4P25789 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms