Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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