Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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