Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms