Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB4P17483 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms