Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms