Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms