Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDGFRAP16234 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms