Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM27P14373 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms