Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms