Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN2P0C2S0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms