Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED1O96006 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED1O96006 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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