Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNTO95613 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNTO95613 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNTO95613 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNTO95613 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNTO95613 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNTO95613 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNTO95613 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms