Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms