Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms