Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG12O94817 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG12O94817 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms