Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA4O75335 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms