Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms