Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPLO60437 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPLO60437 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPLO60437 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPLO60437 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPLO60437 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPLO60437 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPLO60437 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms