Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms