Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms