Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRPO00591 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRPO00591 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRPO00591 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms