Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms