Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms