Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms