Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms