Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms