Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms