Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM221AA4D161 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM221AA4D161 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms