Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms