Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms