Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms