Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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