Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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