Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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