Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NBPF12-207ENST00000617864 2051 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC011297.1-201ENST00000620503 2110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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