Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms