Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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