Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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