Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms