Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms