Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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RABGEF1Q9UJ41 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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