Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms